RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	DRP2	Q13474	957 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CYP1B1	Q16678	543 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	RDM1	Q8NG50	284 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	C18orf8	Q96DM3	657 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PGM2	Q96G03	612 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TBX20	Q9UMR3	447 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SNX24	Q9Y343	169 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	BACH1	O14867	736 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CYP26A1	O43174	497 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SPOP	O43791	374 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	FSBP	O95073	299 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PDE6C	P51160	858 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ENPEP	Q07075	957 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	XKR9	Q5GH70	373 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TMC2	Q8TDI7	906 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CENPT	Q96BT3	561 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	NT5C1B	Q96P26	610 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ADRB2	P07550	413 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CDR2	Q01850	454 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SLMAP	Q14BN4	828 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CPXCR1	Q8N123	301 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	KAT5	Q92993	513 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	FAM81B	Q96LP2	452 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	NUP85	Q9BW27	656 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	VPS33B	Q9H267	617 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	BCS1L	Q9Y276	419 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CYP11B1	P15538	503 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CNGA1	P29973	690 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	FNTA	P49354	379 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	FMO1	Q01740	532 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SPP2	Q13103	211 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PGM5	Q15124	567 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	GINM1	Q9NU53	330 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	19.78	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TMOD1	P28289	359 aa		19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ADSS	P30520	456 aa		19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	MARCKSL1	P49006	195 aa		19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	RWDD2B	P57060	319 aa		19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TTLL6	Q8N841	843 aa		19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF653	Q96CK0	615 aa		19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MME	P08473	750 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	PYGM	P11217	842 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	NPTX2	P47972	431 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	UGCG	Q16739	394 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	AADACL2	Q6P093	401 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	PASK	Q96RG2	1323 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf60	A6NFR6	353 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	FDX1	P10109	184 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75

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