RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP2J2P51589 502 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 IKBKEQ14164 716 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM240Q5SV17 173 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 SAAL1Q96ER3 474 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSG101Q99816 390 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 HES2Q9Y543 173 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 C9IYK1 514 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 NR3C1P04150 777 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF445P59923 1031 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRC63Q05C16 580 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM192Q8IY95 271 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 DMAC2Q9NW81 257 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 IPPQ9Y573 584 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTC3P53804 2025 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A0U1RQF3 1178 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 BICDL2A1A5D9 508 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 H0YGN5 161 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 OGTO15294 1046 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM189A1O60320 539 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 FGBP02675 491 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 NR2F2P24468 414 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACOT2P49753 483 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 OSTNP61366 133 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 NFIL3Q16649 462 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACTN1P12814 892 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNFSF9P41273 254 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM189BP81408 668 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADAM9Q13443 819 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 APOL6Q9BWW8 343 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF39Q9H2S5 420 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNTG2Q9NY99 539 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF623O75123 536 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 STAG3L1P0CL83 205 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRM5P41594 1212 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CASP4P49662 377 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAB27AP51159 221 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPD1LQ8N335 351 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 RDH13Q8NBN7 331 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF169Q8NCN4 708 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 LPPQ93052 612 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSPY26PQ9H489 355 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIP11Q15643 1979 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CITO14578 2027 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 EXOC3O60645 756 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 AKAP5P24588 427 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF165P49910 485 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 DEFB103AP81534 67 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYBPC2Q14324 1141 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP135Q66GS9 1140 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms