RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 SLC18A3Q16572 532 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 CCL14Q16627 93 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 ZNF569Q5MCW4 686 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 CCDC122Q5T0U0 273 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 GJB7Q6PEY0 223 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 SV2AQ7L0J3 742 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 METTL13Q8N6R0 699 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 JAKMIP2Q96AA8 810 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 FAM81BQ96LP2 452 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 WDR24Q96S15 920 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 ZIC5Q96T25 663 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 MSTO1Q9BUK6 570 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 TUBB2BQ9BVA1 445 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 PTPRHQ9HD43 1115 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 TRPM7Q96QT4 1865 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 RCCD1A6NED2 376 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 F8VZ95 297 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ABLIM1O14639 778 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 FANCGO15287 622 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ADCY6O43306 1168 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ABL1P00519 1130 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ZNF286BP0CG31 522 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 CTGFP29279 349 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 CYP2C19P33261 490 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 PHKA2P46019 1235 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 CLCN3P51790 818 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 IGBP1P78318 339 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 PTK2Q05397 1052 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 PPFIA1Q13136 1202 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 NOGQ13253 232 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 SURF1Q15526 300 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 GRIK4Q16099 956 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 MARCH8Q5T0T0 291 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 FBXL13Q8NEE6 735 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ZNF516Q92618 1163 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 GPR88Q9GZN0 384 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 LACRTQ9GZZ8 138 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 RAB20Q9NX57 234 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 GUCA1BQ9UMX6 200 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 TNFSF13BQ9Y275 285 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 A0A087X0T9 212 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 UQCRHLA0A096LP55 91 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 HAS3O00219 553 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 OGTO15294 1046 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 FAM189A1O60320 539 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 KPNA6O60684 536 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 F2P00734 622 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 UQCRHP07919 91 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 FAM228BP0C875 321 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ACOT2P49753 483 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 CPT1AP50416 773 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 MFAP3P55082 362 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ARID5AQ03989 594 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 KIF22Q14807 665 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 NAB2Q15742 525 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ZACNQ401N2 412 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ATF7IP2Q5U623 682 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 MPZL3Q6UWV2 235 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 TLK2Q86UE8 772 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ZNF410Q86VK4 478 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 VPS36Q86VN1 386 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 ARHGEF19Q8IW93 802 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 SLC35F6Q8N357 371 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 TAS1R2Q8TE23 839 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 KAT2BQ92831 832 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 SEMA4DQ92854 862 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 NLRP4Q96MN2 994 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 NT5C1BQ96P26 610 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 FNBP1Q96RU3 617 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 MAP7D2Q96T17 732 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-209ENST00000547449 SYT11Q9BT88 431 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms