RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.17□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.17□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 STK17AQ9UEE5 414 aa6.17□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPRSQ13332 1948 aa6.17□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SIP14410 1827 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ARL5CA6NH57 179 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB39O15060 712 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 GRM6O15303 877 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPAN1O60635 241 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 HIP1RO75146 1068 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 OFD1O75665 1012 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM13AO94988 1023 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 C1RP00736 705 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 URODP06132 367 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 THP07101 528 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA2G4BP0C869 781 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 PLS3P13797 630 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 IL9P15248 144 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 LIG1P18858 919 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SYT1P21579 422 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 FGFR4P22455 802 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 PAX3P23760 479 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 DDIT3P35638 169 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 OR1G1P47890 313 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 GRIK3Q13003 919 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 DRP2Q13474 957 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 STK38Q15208 465 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SV2BQ7L1I2 683 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR65Q8IYL9 337 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 VPS52Q8N1B4 723 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 IGSF21Q96ID5 467 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 UROC1Q96N76 676 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 TCF25Q9BQ70 676 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 GBP3Q9H0R5 595 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 FZD8Q9H461 694 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 CUEDC2Q9H467 287 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 CWH43Q9H720 699 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 PARVGQ9HBI0 331 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 CD207Q9UJ71 328 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 NR2E1Q9Y466 385 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 IPPQ9Y573 584 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 INPPL1O15357 1258 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 CLDN3O15551 220 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 TADA2AO75478 443 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 TOM1L1O75674 476 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGEF15O94989 841 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 NPTXRO95502 500 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 CXCL14O95715 111 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ADH1AP07327 375 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 GAP43P17677 238 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 KLRC2P26717 231 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 NPTX2P47972 431 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 NRIP1P48552 1158 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 PEX3P56589 373 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ZP2Q05996 745 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 COASYQ13057 564 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAM15Q13444 863 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 TUSC3Q13454 348 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ALCAMQ13740 583 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 NBR1Q14596 966 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 POSTNQ15063 836 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 USP41Q3LFD5 358 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.15□□□□□ -1.42
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