RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM71BQ8TC56 605 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 RNF141Q8WVD5 230 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SPTLC2O15270 562 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SIN3BO75182 1162 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 A1BGP04217 495 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 USP11P51784 963 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 UBE3AQ05086 875 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 DCTN1Q14203 1278 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCDC158Q5M9N0 1113 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.23□□□□□ -1.41
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CSNK1G3-210ENST00000521364 IQCEQ6IPM2 695 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 AFG1LQ8WV93 481 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 DPF3Q92784 378 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 WNT8BQ93098 351 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 COG8Q96MW5 612 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PTPN18Q99952 460 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ASPNQ9BXN1 380 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 GNAT1P11488 350 aa6.23□□□□□ -1.41
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CSNK1G3-210ENST00000521364 PTPN14Q15678 1187 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAB30Q15771 203 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 DLG3Q92796 817 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 TNFRSF25Q93038 417 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAX2Q96IS3 184 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CLDND1Q9NY35 253 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRR13Q9NZ81 148 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 TBK1Q9UHD2 729 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.23□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CLGNO14967 610 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC4A1P02730 911 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 BCRP11274 1271 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MYL4P12829 197 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 FGFR4P22455 802 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ALAS2P22557 587 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIF5BP33176 963 aa6.22□□□□□ -1.41
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CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC12A1Q13621 1099 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 Q6ZNB5 142 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZWILCHQ9H900 591 aa6.22□□□□□ -1.41
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CSNK1G3-210ENST00000521364 SHISA3A0PJX4 238 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ISM1B1AKI9 464 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ASNA1O43681 348 aa6.22□□□□□ -1.41
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CSNK1G3-210ENST00000521364 APOL3O95236 402 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCR9P51686 369 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 HK3P52790 923 aa6.22□□□□□ -1.41
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CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MCM10Q7L590 875 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CEP97Q8IW35 865 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 HIC2Q96JB3 615 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 BTG4Q9NY30 223 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.22□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 LRIG2O94898 1065 aa6.21□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 LSAMPQ13449 338 aa6.21□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 UBE3CQ15386 1083 aa6.21□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 UVSSAQ2YD98 709 aa6.21□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.21□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.21□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.21□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 NLRP10Q86W26 655 aa6.21□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 KSR1Q8IVT5 923 aa6.21□□□□□ -1.41
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