RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 LILRA6Q6PI73 481 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 Q8TCH9 128 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 IL17RAQ96F46 866 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 LOXL4Q96JB6 756 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 SAMD11Q96NU1 681 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 IPPQ9Y573 584 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC154A6NI56 674 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 STC2O76061 302 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 PF4V1P10720 104 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 VCAM1P19320 739 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 EDNRBP24530 442 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 SREBF1P36956 1147 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 APBA1Q02410 837 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 UAP1L1Q3KQV9 507 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 D2HGDHQ8N465 521 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 REPS2Q8NFH8 660 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 MDM1Q8TC05 714 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 HDAC10Q969S8 669 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 BORCS6Q96GS4 357 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 CDH19Q9H159 772 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 EPC1Q9H2F5 836 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 CD248Q9HCU0 757 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 COMTP21964 271 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 PTPN7P35236 360 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 SLC6A9P48067 706 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 MFSD5Q6N075 450 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ZMYM3Q14202 1370 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 HHEXQ03014 270 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 IL10RAQ13651 578 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 PPP2R5AQ15172 486 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC41Q15345 812 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 HS1BP3Q53T59 392 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 Q6ZSN1 163 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 CHST13Q8NET6 341 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 DEF6Q9H4E7 631 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 LDAHQ9H6V9 325 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 LANCL2Q9NS86 450 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 RFPL1O75677 317 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 POU2F2P09086 479 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 AKAP5P24588 427 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 GUCY1A2P33402 732 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 FAM47AQ5JRC9 791 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 STON2Q8WXE9 905 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 CEP95Q96GE4 821 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 FAM89AQ96GI7 184 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms