RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	TSC1	Q92574	1164 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	NT5C1B	Q96P26	610 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	POLD4	Q9HCU8	107 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101		K7ERI5	159 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ASAP2	O43150	1006 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ADCY3	O60266	1144 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	HBP1	O60381	514 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM253	P0C7T8	217 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ADSS	P30520	456 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PAFAH1B1	P43034	410 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GCNT1	Q02742	428 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ARID5A	Q03989	594 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	LAMC2	Q13753	1193 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TCEAL1	Q15170	157 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SURF1	Q15526	300 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MAP9	Q49MG5	647 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC181	Q5TID7	509 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	LMO3	Q8TAP4	145 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	FGD4	Q96M96	766 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CEP89	Q96ST8	783 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GPR20	Q99678	358 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MCM3AP	O60318	1980 aa		10.42	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CENPF	P49454	3210 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MOCS3	O95396	460 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ADRB2	P07550	413 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	HOXC6	P09630	235 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ATP4A	P20648	1035 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GLRA2	P23416	452 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GCLM	P48507	274 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	BPIFB4	P59827	614 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PPP3CA	Q08209	521 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	WDR93	Q6P2C0	686 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	RDH13	Q8NBN7	331 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	RFFL	Q8WZ73	363 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TAF4B	Q92750	862 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GLG1	Q92896	1179 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SPATA33	Q96N06	139 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PCYT2	Q99447	389 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SYT11	Q9BT88	431 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PRO3102	Q9H379	93 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ANKRD62	A6NC57	917 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PDHX	O00330	501 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MAGEB2	O15479	319 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	FKTN	O75072	461 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ABL1	P00519	1130 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GH1	P01241	217 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GZMA	P12544	262 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TNFAIP3	P21580	790 aa		10.4	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MAPK4	P31152	587 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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