RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 BORCS6Q96GS4 357 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SPATA33Q96N06 139 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ACCSQ96QU6 501 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CEP89Q96ST8 783 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GPR20Q99678 358 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SIP14410 1827 aa6.7□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 MGAMO43451 1857 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DENND3A2RUS2 1198 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ASB14A6NK59 587 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ARHGAP6O43182 974 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ADCY6O43306 1168 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 STX10O60499 249 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 NOL4O94818 638 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TPM1P09493 284 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM49P0CI25 452 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM49CP0CI26 452 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TNNT1P13805 278 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SLC9A1P19634 815 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GPC1P35052 558 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 STAT5BP51692 787 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GDF10P55107 478 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GTF2BQ00403 316 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 POU4F2Q12837 409 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DRP2Q13474 957 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 NEDD9Q14511 834 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PLCB4Q15147 1175 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 RGMBQ6NW40 437 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 METTL7BQ6UX53 244 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DPP9Q86TI2 863 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CNGA4Q8IV77 575 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GLG1Q92896 1179 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FAM84AQ96KN4 292 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DRC1Q96MC2 740 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DNAJC7Q99615 494 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 KATNBL1Q9H079 304 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GBP3Q9H0R5 595 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DMAC2Q9NW81 257 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 TBX20Q9UMR3 447 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 UBE4BO95155 1302 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PASKQ96RG2 1323 aa6.69□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.68□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.68□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 NRDCO43847 1150 aa6.68□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 EXOC3O60645 756 aa6.68□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms