RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460978.1

ULK4-208, Transcript of unc-51 like kinase 4, human

TSL 2

Gene ULK4, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ULK4-208	ENST00000460978	PRKD3	O94806	890 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	MRE11	P49959	708 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	MEOX1	P50221	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	KCNQ1	P51787	676 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	BCAR1	P56945	870 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PICALM	Q13492	652 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	MORC3	Q14149	939 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	LPP	Q93052	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	NPHP1	O15259	732 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	FKBP9	O95302	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	MT-CO1	P00395	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PF4V1	P10720	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	TRIM27	P14373	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SLC9A1	P19634	815 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PTGS2	P35354	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ADCY8	P40145	1251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	NEK3	P51956	506 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	C21orf58	P58505	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PHC1	P78364	1004 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	FAP	Q12884	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	CRHR2	Q13324	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	LENG9	Q96B70	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	NUDT3	O95989	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	CD40	P25942	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	CYP2C19	P33261	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	LSS	P48449	732 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	RGS3	P49796	1198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SCNN1G	P51170	649 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	FSTL1	Q12841	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SARG	Q9BW04	601 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	TGM5	O43548	720 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	ULK1	O75385	1050 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
ULK4-208	ENST00000460978	DGKD	Q16760	1214 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms