RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RARAP10276 462 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PLS3P13797 630 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PALM2Q8IXS6 379 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PRELID2Q8N945 189 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CFAP73A6NFT4 308 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RIPK2O43353 540 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SMIM24O75264 130 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RTN2O75298 545 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 BAG2O95816 211 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SHMT1P34896 483 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RCN2Q14257 317 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC89Q8N998 374 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 AGAP11Q8TF27 550 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RAB20Q9NX57 234 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 LRRD1A4D1F6 860 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RASA3Q14644 834 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CEP55Q53EZ4 464 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 HES6Q96HZ4 224 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM206Q9H813 350 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MYH7P12883 1935 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DISP2A7MBM2 1401 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 BBS9Q3SYG4 887 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CHADLQ6NUI6 762 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.67□□□□□ -0.06
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SGMS1-203ENST00000429490 A8MUI8 341 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RARGP13631 454 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NPEPPSP55786 919 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 COPS2P61201 443 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DCAF4Q8WV16 495 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SLC5A5Q92911 643 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SNF8Q96H20 258 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM237Q96Q45 408 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 19.3
SGMS1-203ENST00000429490 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TGFB1I1O43294 461 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GH1P01241 217 aa14.66□□□□□ -0.06
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SGMS1-203ENST00000429490 ECE1P42892 770 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 LIG4P49917 911 aa14.66□□□□□ -0.06
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SGMS1-203ENST00000429490 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 HAO1Q9UJM8 370 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ARP10275 920 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 GPS1Q13098 491 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DUPD1Q68J44 220 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CEP170P1Q96L14 293 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 USP20Q9Y2K6 914 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 PPFIA2O75334 1257 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KRT1P04264 644 aa14.66□□□□□ -0.06
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