RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 SHC3Q92529 594 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 FAM81BQ96LP2 452 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 COG5Q9UP83 839 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PCNTO95613 3336 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 GCLMP48507 274 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 SPP2Q13103 211 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 CEP85LQ5SZL2 805 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 KIFAP3Q92845 792 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 GPRASP2Q96D09 838 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 FBXL18Q96ME1 805 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 RUNDC3BQ96NL0 473 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PXMP2Q9NR77 195 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 TBX20Q9UMR3 447 aa25.62■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 TTI1O43156 1089 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 DAPK3O43293 454 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 LRRN2O75325 713 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 ERLIN2O94905 339 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PTPRAP18433 802 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 VCAM1P19320 739 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 MAGEA9P43362 315 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 GPC3P51654 580 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 RTP1P59025 263 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 DUPD1Q68J44 220 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 KRT39Q6A163 491 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 EPS8L1Q8TE68 723 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 BACH1O14867 736 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PEX3P56589 373 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PALB2Q86YC2 1186 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 SLC20A1Q8WUM9 679 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 ERP44Q9BS26 406 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 KCNG1Q9UIX4 513 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PPFIA2O75334 1257 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 CHRNA3P32297 505 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 DR1Q01658 176 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 RMDN3Q96TC7 470 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 TXLNGYQ9BZA5 131 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 FAM129AQ9BZQ8 928 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 NEUROG2Q9H2A3 272 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.6■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 SLC16A4O15374 487 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 SCP2P22307 547 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 DGKZQ13574 1117 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 XKR9Q5GH70 373 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 CPXCR1Q8N123 301 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 C3orf20Q8ND61 904 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 KCNN1Q92952 543 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 EPN3Q9H201 632 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 ELP3Q9H9T3 547 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 UVRAGQ9P2Y5 699 aa25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 CYP1A2P05177 515 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 CHRNB2P17787 502 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 MDH1P40925 334 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 OAZ1P54368 228 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 UGCGQ16739 394 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 KCTD16Q68DU8 428 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 SH2D3CQ8N5H7 860 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PCYOX1Q9UHG3 505 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 GGA2Q9UJY4 613 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.58■■□□□ 1.69
PMS1-205ENST00000409985 TISP43B9A030 160 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 H0YCG3 227 aa25.57■■□□□ 1.68
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