RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408953.3

ZBED8-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED8, Length 2,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-201ENST00000408953 CYP1B1Q16678 543 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 SLF2Q8IX21 1173 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 CD101Q93033 1021 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 IFT74Q96LB3 600 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 SERPINB12Q96P63 405 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 TBX3O15119 743 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 RPS6KA4O75676 772 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 STX2P32856 288 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF76P36508 570 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 VPS41P49754 854 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 ATP11AP98196 1134 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 BFSP1Q12934 665 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 DYDC2Q96IM9 177 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 FAM20AQ96MK3 541 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 DMAC2Q9NW81 257 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 GGA1Q9UJY5 639 aa14.21□□□□□ -0.13
ZBED8-201ENST00000408953 EMSYQ7Z589 1322 aa14.21□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 BCRP11274 1271 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ABL2P42684 1182 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 AP3B2Q13367 1082 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ODR4Q5SWX8 454 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 NUP85Q9BW27 656 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 POLLQ9UGP5 575 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SLITRK3O94933 977 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 GGPS1O95749 300 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 GCLMP48507 274 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 GRIK3Q13003 919 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CHST7Q9NS84 486 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 O00370 1275 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TTC4O95801 387 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 FOXN2P32314 431 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SCNN1DP51172 638 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 PPP3CAQ08209 521 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SLFN13Q68D06 897 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CNKSR1Q969H4 720 aa14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.2□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 THAP12O43422 761 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SREBF1P36956 1147 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ITGA8P53708 1063 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SGO2Q562F6 1265 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TMEM237Q96Q45 408 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ENO4A6NNW6 628 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 C6orf229H3BNL8 230 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 UNC5CO95185 931 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.19□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 RIMBP2O15034 1052 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CYP26A1O43174 497 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CCNB1P14635 433 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 RWDD2BP57060 319 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 NFIAQ12857 509 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TAF11Q15544 211 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SLC15A2Q16348 729 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms