RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.96□□□□□ -0.98
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CASP4-201ENST00000393150 EFSO43281 561 aa8.92□□□□□ -0.98
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CASP4-201ENST00000393150 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 ADRB1P08588 477 aa8.92□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 CTSAP10619 480 aa8.92□□□□□ -0.98
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