RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 CLIC4Q9Y696 253 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC169A6NNP5 214 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 STX6O43752 255 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 CLUL1Q15846 466 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 STK39Q9UEW8 545 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 IRAK3Q9Y616 596 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SFI1A8K8P3 1242 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 CXCL14O95715 111 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 CTSAP10619 480 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 COASYQ13057 564 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 PARP2Q9UGN5 583 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC15Q8TF66 581 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 MARCH5Q9NX47 278 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SNTG2Q9NY99 539 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 KLK14Q9P0G3 267 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 OR1G1P47890 313 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 GRIK3Q13003 919 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 GIT2Q14161 759 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 ARSHQ5FYA8 562 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 CD320Q9NPF0 282 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 NR1I2O75469 434 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 PLS3P13797 630 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 HSCBQ8IWL3 235 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC16A4O15374 487 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 RECQL4O94761 1208 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 EFEMP2O95967 443 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 PLCG1P19174 1290 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 GJD3Q8N144 294 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 USP28Q96RU2 1077 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIP11Q15643 1979 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.62■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 CA8P35219 290 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 SMTNP53814 917 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 ZP2Q05996 745 aa22.62■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 USP49Q70CQ1 688 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.62■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 RAD54LQ92698 747 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 EPSTI1Q96J88 318 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 PTGESO14684 152 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 LILRB3O75022 631 aa22.61■■□□□ 1.21
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