RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 SLC18A3Q16572 532 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF699Q32M78 642 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 DDHD1Q8NEL9 900 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 APOL6Q9BWW8 343 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 SZRD1Q7Z422 152 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 STX19Q8N4C7 294 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 NEDD4P46934 1319 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 K7ERI5 159 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 AKAP10O43572 662 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 TRIP10Q15642 601 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 HORMAD1Q86X24 394 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 TERB1Q8NA31 727 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 NSL1Q96IY1 281 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 M0R3G1 203 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PPIP5K2O43314 1243 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 TRADDQ15628 312 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 UBE2SQ16763 222 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 NLRP10Q86W26 655 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 CLEC4FQ8N1N0 589 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 GOLGA8RI6L899 631 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PI16Q6UXB8 463 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 AGR3Q8TD06 166 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PREX2Q70Z35 1606 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PDE5AO76074 875 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 SCP2P22307 547 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 GCLMP48507 274 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 SHC4Q6S5L8 630 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ZBTB33Q86T24 672 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRT-204ENST00000373190 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PARVAQ9NVD7 372 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 HSPA2P54652 639 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 RASGRF1Q13972 1273 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 DGKHQ86XP1 1220 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ISCUQ9H1K1 167 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 SFI1A8K8P3 1242 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 STRNO43815 780 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ITIH2P19823 946 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 HACD3Q9P035 362 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 APOL1O14791 398 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 USP17L3A6NCW0 530 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 USP17L4A6NCW7 530 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 EFCAB14O75071 495 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 GNA15P30679 374 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 SFR1Q86XK3 245 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 OLFML3Q9NRN5 406 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 CSADQ9Y600 493 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-204ENST00000373190 E5RI56 91 aa9.28□□□□□ -0.92
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