RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 COG1Q8WTW3 980 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TRPA1O75762 1119 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ANTXR2P58335 489 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 STK4Q13043 487 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 GRAMD1BQ3KR37 738 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PDHBP11177 359 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 WDR24Q96S15 920 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM4Q9C037 500 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 VCPKMTQ9H867 229 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SNX2O60749 519 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.035e-7■□□□□ 11.2
CCSAP-203ENST00000366687 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TKFCQ3LXA3 575 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 NR3C2P08235 984 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CDC42EP1Q00587 391 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 VPS72Q15906 364 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CHP1Q99653 195 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 REEP2Q9BRK0 252 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 KRT82Q9NSB4 513 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 JCADQ9P266 1359 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 APOEP02649 317 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 HOXD10P28358 340 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ATL2Q8NHH9 583 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 C18orf8Q96DM3 657 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 AMACRQ9UHK6 382 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD6Q96KE9 485 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM15Q9C019 465 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 FOXP2O15409 715 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TADA3O75528 432 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 NTSR2O95665 410 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CHGBP05060 677 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 UCHL3P15374 230 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 FMO5P49326 533 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 STILQ15468 1287 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 GANCQ8TET4 914 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 FAM151AQ8WW52 585 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 INTUQ9ULD6 942 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 DEUP1Q05D60 604 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 MICALL2Q8IY33 904 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SLC13A4Q9UKG4 626 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 MYMKA6NI61 221 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 STXBP3O00186 592 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 INPP1P49441 399 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM33Q9UPN9 1127 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CHD1O14646 1710 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 RUBCNQ92622 972 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 HAUS5O94927 633 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 NNMTP40261 264 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEP78395 509 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 AP1B1Q10567 949 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 NME3Q13232 169 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 MORF4L2Q15014 288 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms