RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 ACAD9Q9H845 621 aa22.39■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.39■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP26A1O43174 497 aa22.38■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 KRT14P02533 472 aa22.38■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 ACTR2P61160 394 aa22.38■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.38■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.38■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.38■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.35■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.34■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNN1Q92952 543 aa22.34■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.34■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 H0YGN5 161 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 SORBS3O60504 671 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP4AP20648 1035 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 FLT3P36888 993 aa22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 GNPTABQ3T906 1256 aa22.33■■□□□ 1.17
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KCNQ1-202ENST00000335475 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
KCNQ1-202ENST00000335475 TATDN2Q93075 761 aa22.33■■□□□ 1.17
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