RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 YAF2Q8IY57 180 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 APOL1O14791 398 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 HMBSP08397 361 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 NRBF2Q96F24 287 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 TEKT2Q9UIF3 430 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 PARVAQ9NVD7 372 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 KIF17Q9P2E2 1029 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 STAT5BP51692 787 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 TTC23LQ6PF05 361 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DYRK4Q9NR20 520 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ADA2Q9NZK5 511 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 CAV1Q03135 178 aa23.71■■□□□ 1.39
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PTPRM-201ENST00000332175 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ANKMY2Q8IV38 441 aa23.71■■□□□ 1.39
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PTPRM-201ENST00000332175 SNF8Q96H20 258 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD65E5RJM6 399 aa23.71■■□□□ 1.39
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PTPRM-201ENST00000332175 SYF2O95926 243 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SLC26A7Q8TE54 656 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.397e-7■■■□□ 14.6
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PTPRM-201ENST00000332175 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.7■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf146Q5VVC0 180 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 BTBD6Q96KE9 485 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 TTC26A0AVF1 554 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 PID1Q7Z2X4 250 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 RGS7P49802 495 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 USP11P51784 963 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 TMED1Q13445 227 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 SARM1Q6SZW1 724 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF560Q96MR9 790 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 SHC4Q6S5L8 630 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM33Q9UPN9 1127 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 EXOC4Q96A65 974 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.69■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 MCF2P10911 925 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 IRF1P10914 325 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 ARSEP51690 589 aa23.68■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 AGAP1Q9UPQ3 857 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 CDK17Q00537 523 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 RFX8Q6ZV50 586 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 USP33Q8TEY7 942 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 ARL8AQ96BM9 186 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 NUDCD3Q8IVD9 361 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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PTPRM-201ENST00000332175 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC78A2IDD5 438 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 SYCE1LA8MT33 242 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 KRT17Q04695 432 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 TEKT4Q8WW24 435 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 PGBD4Q96DM1 585 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 TPI1P60174 286 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 EPC1Q9H2F5 836 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-201ENST00000332175 EYA4O95677 639 aa23.67■■□□□ 1.38
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