RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CCDC25Q86WR0 208 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 KSR1Q8IVT5 923 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 IWS1Q96ST2 819 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 WDR18Q9BV38 432 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 NUP85Q9BW27 656 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 HIP1RO75146 1068 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CLTAP09496 248 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SLCO1A2P46721 670 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SLC8A3P57103 927 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 E2F5Q15329 346 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TCP11Q8WWU5 503 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SNF8Q96H20 258 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 FSCN2O14926 492 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TCEA3O75764 348 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 GAS8O95995 478 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 POTEJP0CG39 1038 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 RARAP10276 462 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 POLD1P28340 1107 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MXI1P50539 228 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CEP55Q53EZ4 464 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 BBOF1Q8ND07 529 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 KIFAP3Q92845 792 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CCDC77Q9BR77 488 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.83□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 STAT2P52630 851 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 LMNB2Q03252 620 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 RASA3Q14644 834 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 SGO2Q562F6 1265 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 RDH13Q8NBN7 331 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 ZNF653Q96CK0 615 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 RIT2Q99578 217 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 LXNQ9BS40 222 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 TRIM7Q9C029 511 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 EBF2Q9HAK2 575 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 BATF3Q9NR55 127 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 TMEM120BA0PK00 339 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 CFBP00751 764 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 COPS2P61201 443 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 KRT17Q04695 432 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 TCP10Q12799 353 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 TNIP1Q15025 636 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 GALNTL6Q49A17 601 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 NGLY1Q96IV0 654 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 FAM81BQ96LP2 452 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 TIPINQ9BVW5 301 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 ECT2Q9H8V3 914 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 SUFUQ9UMX1 484 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 ZNF536O15090 1300 aa14.82□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 FAM196BA6NMK8 535 aa14.81□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 UBOX5O94941 541 aa14.81□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 GJB6O95452 261 aa14.81□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 SGPL1O95470 568 aa14.81□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 TTC4O95801 387 aa14.81□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 ALADP13716 330 aa14.81□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 CHRNB2P17787 502 aa14.81□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 CCND1P24385 295 aa14.81□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 GCLMP48507 274 aa14.81□□□□□ -0.04
MKS1-201ENST00000313863 NCALDP61601 193 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms