RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 CLTCL1P53675 1640 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGDIAP52565 204 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC14Q15048 493 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SNX2O60749 519 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SCP2P22307 547 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ACAP3Q96P50 834 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 EFHC2Q5JST6 749 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 CDC26Q8NHZ8 85 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 KITP10721 976 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 GPSM2P81274 684 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 FAM161BQ96MY7 647 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 DIAPH2O60879 1101 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 MCF2P10911 925 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 EFNA5P52803 228 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 GUCY1A3Q02108 690 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 TBX3O15119 743 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ARSEP51690 589 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 TSPY1Q01534 308 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 HIF1AQ16665 826 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ANO5Q75V66 913 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 WRNIP1Q96S55 665 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 WWP1Q9H0M0 922 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 KYAT1Q16773 422 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ACAD9Q9H845 621 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL4Q14679 1199 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 TC2NQ8N9U0 490 aa22.39■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 IFT43Q96FT9 208 aa22.39■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 EPN3Q9H201 632 aa22.39■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 CREB3O43889 395 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 H3BRJ5 948 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CYP26A1O43174 497 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 RXRBP28702 533 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TYK2P29597 1187 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 NCLNQ969V3 563 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CDH6P55285 790 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA21Q7Z572 469 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 GCNAQ96QF7 691 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 E2F6O75461 281 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TMED1Q13445 227 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP69A5D8W1 941 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PHF2O75151 1096 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CDH16O75309 829 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 UCHL3P15374 230 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 GALCP54803 685 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF543Q08ER8 600 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 SPP2Q13103 211 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 KLC4Q9NSK0 619 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 KCND2Q9NZV8 630 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CRB1P82279 1406 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 LDHDQ86WU2 507 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 SP8Q8IXZ3 490 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ING2Q9H160 280 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PIM2Q9P1W9 311 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM247A6NEH6 219 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ZBBXA8MT70 800 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF185O15231 689 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ITIH2P19823 946 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ALKQ9UM73 1620 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-201ENST00000284617 FGFR4P22455 802 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms