RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 FNTAP49354 379 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 IGBP1P78318 339 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC63Q05C16 580 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 KCNJ12Q14500 433 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 UBE4BO95155 1302 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC169A6NNP5 214 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFAB1O14561 156 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 SRGAP2O75044 1071 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 PGK1P00558 417 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 ELF1P32519 619 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 PRMT2P55345 433 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 PPP2R5AQ15172 486 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 CHP1Q99653 195 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 C22orf31O95567 290 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 GLRA2P23416 452 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 HINFPQ9BQA5 517 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 COL1A2P08123 1366 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 INHAP05111 366 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TSG101Q99816 390 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 IFT74Q96LB3 600 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 CHUKO15111 745 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 SMTNP53814 917 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 GTF2BQ00403 316 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 UBXN1Q04323 297 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 MFSD10Q14728 455 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 EXOC8Q8IYI6 725 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 THAP9Q9H5L6 903 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS4O75173 837 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 NKX3-2P78367 333 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 ALCAMQ13740 583 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 GRIK4Q16099 956 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 GNASQ5JWF2 1037 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 MIEF2Q96C03 454 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 MCM8Q9UJA3 840 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TGFB1I1O43294 461 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 FSBPO95073 299 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 GRK4P32298 578 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 SPAG1Q07617 926 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 IER5Q5VY09 327 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 EVPLQ92817 2033 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 HAS3O00219 553 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 KLRC1P26715 233 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 PSEN2P49810 448 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 CLCN3P51790 818 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 TCP11Q8WWU5 503 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 SPC25Q9HBM1 224 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 SAR1BQ9Y6B6 198 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 PDXKO00764 312 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 CAPSQ13938 189 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-201ENST00000265339 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms