RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr457Q8VGP5 313 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Txndc5Q91W90 417 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cbx6Q9DBY5 414 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cpsf3Q9QXK7 684 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Egfl7Q9QXT5 275 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Spata31d1aE9QA35 1336 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vmn2r121A2BE32 847 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cyp2b23E9Q593 491 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gimap9G3X987 291 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pla2g4bP0C871 782 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 SarsP26638 512 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Crtc1Q68ED7 630 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sox30Q8CGW4 782 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mical1Q8VDP3 1048 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Q9D2Q3 444 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sdr42e1Q9D665 394 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cfap45Q9D9U9 551 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Bcl11aQ9QYE3 773 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 ThadaA8C756 1938 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tmem240B2RWJ3 173 aa20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rgs2O08849 211 aa20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kiaa1841Q68FF0 718 aa20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sh3d21Q7TSG5 549 aa20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 RimklbQ80WS1 387 aa20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Agbl3Q8CDP0 1006 aa20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rftn2Q8CHX7 500 aa20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cfap53Q9D439 514 aa20.27■□□□□ 0.84
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm6583E9Q8Z1 469 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tnfrsf11aO35305 625 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 DcxO88809 366 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sppl2bQ3TD49 578 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Daam2Q80U19 1115 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr393Q8VGR6 312 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mfap3Q922T2 349 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Plekha5E9Q6H8 1269 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prl2c2P04095 224 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Yap1P46938 488 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ndufs6P52503 116 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atp13a4Q5XF90 1193 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ift88Q61371 824 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zcchc14Q8VIG0 956 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 B4galt3Q91YY2 395 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cst12Q9DAN8 128 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 March8Q9DBD2 286 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Usp29Q9ES63 869 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dclk1Q9JLM8 756 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Chaf1aQ9QWF0 911 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fbxo17Q9QZM8 286 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm10801F7C7Q0 168 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pla2g4aP47713 748 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Wdr5P61965 334 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 VegfaQ00731 214 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Bcar1Q61140 874 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Klhl17Q6TDP3 640 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 FtoQ8BGW1 502 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MiosQ8VE19 875 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Chd1lQ9CXF7 900 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kcnq4Q9JK97 696 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hmx1O70218 332 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 IkbkbO88351 757 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GpiP06745 558 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adssl1P28650 457 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mfsd14aP70187 490 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 DsppP97399 934 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rplp2P99027 115 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 EnahQ03173 802 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Smpd1Q04519 627 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hace1Q3U0D9 909 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 B230104I21RikQ3USW4 141 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GartQ64737 1010 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znf280dQ68FE8 974 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr23Q7TRX4 325 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ints8Q80V86 995 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pdlim2Q8R1G6 349 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lpin2Q99PI5 893 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ttc9bQ9D6E4 239 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Magi2Q9WVQ1 1275 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pex10B1AUE5 324 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 IapP03975 557 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gp6P0C191 313 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GcP21614 476 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18 ms