RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	INA	Q16352	499 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	CNBD2	Q96M20	576 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	C5orf60	A6NFR6	353 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895		F8W031	263 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	MCF2	P10911	925 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ITGA6	P23229	1130 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	PIK3CA	P42336	1068 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	MAGEB18	Q96M61	343 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	GCNT4	Q9P109	453 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A087X0B3	334 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	PRKAB2	O43741	272 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	GCNT3	O95395	438 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	PSMG1	O95456	288 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	INHBA	P08476	426 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	KRT5	P13647	590 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	YY1	P25490	414 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	GPBP1	Q86WP2	473 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ERMN	Q8TAM6	284 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	SFI1	A8K8P3	1242 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	LYN	P07948	512 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	BCR	P11274	1271 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	VCAM1	P19320	739 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ABL2	P42684	1182 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	PRR16	Q569H4	304 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	APPL1	Q9UKG1	709 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	NR1H3	Q13133	447 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBBX	A8MT70	800 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	TTLL1	O95922	423 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	STAT2	P52630	851 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	CDK17	Q00537	523 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNH2	Q12809	1159 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	MAPK7	Q13164	816 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	MYBPC3	Q14896	1274 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	LGSN	Q5TDP6	509 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	EURL	Q9NYK6	297 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895		A6NJR5	290 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBED4	O75132	1171 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	ITGA2B	P08514	1039 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC166	P0CW27	439 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	TRIM16L	Q309B1	348 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	INPP5D	Q92835	1189 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	C18orf8	Q96DM3	657 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	SERPINB12	Q96P63	405 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	LCA5L	O95447	670 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	CYP2J2	P51589	502 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	KRT17	Q04695	432 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	PTK2	Q05397	1052 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	TTI2	Q6NXR4	508 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPIN3-231	ENST00000639895	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48

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