RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	CDC25A	P30304	524 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	ACCSL	Q4AC99	568 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SNF8	Q96H20	258 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SYCE1L	A8MT33	242 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015		F5H6K3	240 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	PFDN1	O60925	122 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	KLRC3	Q07444	240 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	RRM2B	Q7LG56	351 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	EYA4	O95677	639 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	OCM2	P0CE71	109 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SPP2	Q13103	211 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	PDIA5	Q14554	519 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	CASP8	Q14790	479 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	ING2	Q9H160	280 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	GYG2	O15488	501 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC22	O60826	627 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SERPINB4	P48594	390 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	UGP2	Q16851	508 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	MED15	Q96RN5	788 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	PLAA	Q9Y263	795 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	HDAC4	P56524	1084 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	AFF2	P51816	1311 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	CPD	O75976	1380 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015		A0A1W2PQC6	194 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	DTNB	O60941	627 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	DNAJC6	O75061	913 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	DGAT1	O75907	488 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31	1e-6	■■■■■ 56.2
ARID1B-223	ENST00000637015	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31	9e-7	■□□□□ 8.8
ARID1B-223	ENST00000637015	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	POTEM	A6NI47	508 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SMAP	O00193	183 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	PDXK	O00764	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	CD4	P01730	458 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	MME	P08473	750 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	RFC5	P40937	340 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	RBP5	P82980	135 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	TBX3	O15119	743 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	CSPG5	O95196	566 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	HIST1H2AD	P20671	130 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	AP1B1	Q10567	949 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	IER5	Q5VY09	327 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	LCA5	Q86VQ0	697 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ARID1B-223	ENST00000637015	KIF1B	O60333	1816 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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