RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP2R5A	Q15172	486 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	VPS52	Q8N1B4	723 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	BSND	Q8WZ55	320 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	IGSF21	Q96ID5	467 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDHD2	O94830	711 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	CXCL14	O95715	111 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	ALDH2	P05091	517 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	MLH1	P40692	756 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	GAD1	Q99259	594 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	MUC3A	Q02505	3323 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARL5C	A6NH57	179 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029		E9PMD0	336 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	NAMPT	P43490	491 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAPK6	Q16659	721 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A1B0GUA9	196 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	COASY	Q13057	564 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIFAP3	Q92845	792 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	BACH2	Q9BYV9	841 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	PARP2	Q9UGN5	583 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	B4GALT3	O60512	393 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	EYA4	O95677	639 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRKCB	P05771	671 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	AKAP5	P24588	427 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZFP42	Q96MM3	310 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	FZD8	Q9H461	694 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	OR1G1	P47890	313 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCNN1G	P51170	649 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZP2	Q05996	745 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3B-215	ENST00000621029	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	32.01	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM187B	Q17R55	369 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	32.01	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZBP1	Q9H171	429 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	KLK14	Q9P0G3	267 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	NRP1	O14786	923 aa		32	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	N4BP3	O15049	544 aa		32	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	NR1I2	O75469	434 aa		32	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLIN2	Q99541	437 aa		32	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	APOL5	Q9BWW9	433 aa		32	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP20	Q9Y2K6	914 aa		32	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC169	A6NNP5	214 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	EFNA5	P52803	228 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	CUL4A	Q13619	759 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	MIOS	Q9NXC5	875 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	STK39	Q9UEW8	545 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACKR2	O00590	384 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	CTSA	P10619	480 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	PDC	P20941	246 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	GIT2	Q14161	759 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	BRAP	Q7Z569	592 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	CASP10	Q92851	521 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	HIP1R	O75146	1068 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	PEX3	P56589	373 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNK18	Q7Z418	384 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	DRC1	Q96MC2	740 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SEMA3B-215	ENST00000621029	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		31.97	■■■□□ 2.71

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