RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 PNMA2Q9UL42 364 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 NFIBO00712 420 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ARIH2O95376 493 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 GNAT2P19087 354 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 GUCY2CP25092 1073 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 SLC1A4P43007 532 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ARHGAP1Q07960 439 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 HDXQ7Z353 690 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 NUDT8Q8WV74 236 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TOP1MTQ969P6 601 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 OSBP2Q969R2 916 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 PPME1Q9Y570 386 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 A0A1W2PQH9 124 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 CAND2O75155 1236 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 HTR3BO95264 441 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 RB1P06400 928 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 MAP2K3P46734 347 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 GHRHRQ02643 423 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 POU4F3Q15319 338 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 C2orf27AQ580R0 203 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 SLC30A10Q6XR72 485 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 SERINC5Q86VE9 423 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 FBXO11Q86XK2 927 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 KBTBD3Q8NAB2 608 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ELOA3Q8NG57 546 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 DCAF4Q8WV16 495 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 WNT8BQ93098 351 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ASIC4Q96FT7 647 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 UIMC1Q96RL1 719 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TMEM260Q9NX78 707 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 MUTYHQ9UIF7 546 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TMEM221A6NGB7 291 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 M0R296 226 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 FOXP2O15409 715 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 GPAA1O43292 621 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TBX10O75333 385 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 AMHP03971 560 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 SNHG28P0DPA3 235 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 MCCP23508 829 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 PDE4BQ07343 736 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 HYAL1Q12794 435 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 GPM6BQ13491 265 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 NSMFQ6X4W1 530 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 RPAINQ86UA6 219 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TMEM192Q8IY95 271 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 FBXL6Q8N531 539 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 COPS5Q92905 334 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 KRT82Q9NSB4 513 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 KLF15Q9UIH9 416 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms