RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 OCRLQ01968 901 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM240Q5SV17 173 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 FOXQ1Q9C009 403 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 CASS4Q9NQ75 786 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 MKS1Q9NXB0 559 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 FLT1P17948 1338 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 CFBP00751 764 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ASGR2P07307 311 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 CYP2C8P10632 490 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPP2Q13103 211 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PKDCCQ504Y2 493 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SV2AQ7L0J3 742 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 TTC17Q96AE7 1141 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 OTOFQ9HC10 1997 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 TM4SF5O14894 197 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 GDF11O95390 407 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ALBP02768 609 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PDE6AP16499 860 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 CAP2P40123 477 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SESN3P58005 492 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 CYP4F3Q08477 520 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCRN1Q12765 414 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 GPR158Q5T848 1215 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ISL2Q96A47 359 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 VWCEQ96DN2 955 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PAG1Q9NWQ8 432 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PMM2O15305 246 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 LILRB5O75023 590 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SOD2P04179 222 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYL3P08590 195 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 RBP3P10745 1247 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ITIH2P19823 946 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 HOXD10P28358 340 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PSMC4P43686 418 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 HMGCS2P54868 508 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADCY1Q08828 1119 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 MOGSQ13724 837 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 GALEQ14376 348 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 C17orf99Q6UX52 265 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 NBPF11Q86T75 865 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SKAP1Q86WV1 359 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 AIFM3Q96NN9 605 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PIDD1Q9HB75 910 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms