RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		21.32	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		21.32	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		21.32	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		21.32	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	BACH2	Q9BYV9	841 aa		21.32	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		21.32	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	TRIO	O75962	3097 aa		21.32	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	NPTXR	O95502	500 aa		21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	KCNC3	Q14003	757 aa		21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	BSND	Q8WZ55	320 aa		21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	GAD1	Q99259	594 aa		21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	RAB34	Q9BZG1	259 aa		21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	POLD4	Q9HCU8	107 aa		21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		21.31	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	ARL5C	A6NH57	179 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061		H3BQV1	296 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	ALDH2	P05091	517 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	ALAD	P13716	330 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	LIG1	P18858	919 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	CYP11B2	P19099	503 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	MUT	P22033	750 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	SCNN1G	P51170	649 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	HACE1	Q8IYU2	909 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	ZFP42	Q96MM3	310 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	PP2D1	A8MPX8	630 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	NRP1	O14786	923 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	DCX	O43602	365 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	CTSA	P10619	480 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	AKAP5	P24588	427 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	OR1G1	P47890	313 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	PDIA5	Q14554	519 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	CASP10	Q92851	521 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		21.29	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061		A0A1B0GUA9	196 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	LAD1	O00515	517 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	GPR37L1	O60883	481 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	MCM2	P49736	904 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	KRT79	Q5XKE5	535 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	RNF135	Q8IUD6	432 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	S1PR5	Q9H228	398 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	MIOS	Q9NXC5	875 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	PARP2	Q9UGN5	583 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		21.28	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	PRKCB	P05771	671 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	CDC25A	P30304	524 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	NAMPT	P43490	491 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	IL17A	Q16552	155 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	SUSD6	Q92537	303 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	IFT74	Q96LB3	600 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	FZD8	Q9H461	694 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	KLK14	Q9P0G3	267 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	CDH22	Q9UJ99	828 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	USP20	Q9Y2K6	914 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061	STK24	Q9Y6E0	443 aa		21.27	■■□□□ 1
ILF3-223	ENST00000593061		E9PMD0	336 aa		21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	INPPL1	O15357	1258 aa		21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	PRPH	P41219	470 aa		21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	GIT2	Q14161	759 aa		21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	PPP2R5A	Q15172	486 aa		21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	PTPN14	Q15678	1187 aa		21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	MAPK6	Q16659	721 aa		21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	FAM187B	Q17R55	369 aa		21.26	■□□□□ 0.99

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