RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP2R5EQ16537 467 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 USP37Q86T82 979 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 MEIOBQ8N635 442 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 RDM1Q8NG50 284 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 WHAMMQ8TF30 809 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 SIX2Q9NPC8 291 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 APEX2Q9UBZ4 518 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC188H7C350 402 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBED4O75132 1171 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF4AO95239 1232 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 FTCDO95954 541 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM253P0C7T8 217 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 PLS3P13797 630 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 CAPN2P17655 700 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP2J2P51589 502 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT76Q01546 638 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 BFSP1Q12934 665 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 MTMR1Q13613 665 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 CUL1Q13616 776 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 PEX26Q7Z412 305 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 RFFLQ8WZ73 363 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 BORCS6Q96GS4 357 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMB7Q99436 277 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 MAF1Q9H063 256 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 DMAC2Q9NW81 257 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 NENFQ9UMX5 172 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 SAMM50Q9Y512 469 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 PFASO15067 1338 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNK3O14649 394 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS6KA5O75582 802 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ARP10275 920 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 BMP2P12643 396 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 CXCR5P32302 372 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ACTN2P35609 894 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 CASP4P49662 377 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 UBXN2AP68543 259 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 TKFCQ3LXA3 575 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 DCAF15Q66K64 600 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 MREGQ8N565 214 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 USP38Q8NB14 1042 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 JDP2Q8WYK2 163 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 GDF3Q9NR23 364 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-222ENST00000592408 SFI1A8K8P3 1242 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR64B1ANS9 1081 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 H0YCG3 227 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PMM2O15305 246 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MAN1A2O60476 641 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms