RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 HACE1Q8IYU2 909 aa22.32■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.32■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 RNF39Q9H2S5 420 aa22.32■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 SLC11A1P49279 550 aa22.31■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 HES2Q9Y543 173 aa22.31■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.29■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.29■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 BMP15O95972 392 aa22.29■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.29■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.29■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 ZBP1Q9H171 429 aa22.29■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 N4BP3O15049 544 aa22.28■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.28■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.28■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 KCNK18Q7Z418 384 aa22.28■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.27■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 NRP1O14786 923 aa22.27■■□□□ 1.16
GIPC1-211ENST00000589631 SLC26A4O43511 780 aa22.27■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.27■■□□□ 1.16
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GIPC1-211ENST00000589631 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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GIPC1-211ENST00000589631 DRC1Q96MC2 740 aa22.26■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.26■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 K7ERI5 159 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 HIP1RO75146 1068 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 GUCY2CP25092 1073 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GIPC1-211ENST00000589631 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.25■■□□□ 1.15
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