RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589296.5

CYTH1-209, Transcript of cytohesin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CYTH1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1-209ENST00000589296 CETN1Q12798 172 aa20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 CBWD6Q4V339 395 aa20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 ODR4Q5SWX8 454 aa20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 C12orf42Q96LP6 360 aa20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 FIZ1Q96SL8 496 aa20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.39■□□□□ 0.86
CYTH1-209ENST00000589296 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 BFSP1Q12934 665 aa20.39■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TCEAL1Q15170 157 aa20.39■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 DUPD1Q68J44 220 aa20.39■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.39■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.39■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.39■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ADM5C9JUS6 153 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 KRT13P13646 458 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 GUCY2CP25092 1073 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 EPHX2P34913 555 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 PRKG1Q13976 671 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 CROCCP2Q86T23 111 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 CABS1Q96KC9 395 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 AGPAT1Q99943 283 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 GLTPD2A6NH11 291 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 CHMP2AO43633 222 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 EXOC3O60645 756 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ZBED4O75132 1171 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 IFT88Q13099 833 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 DGKZQ13574 1117 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 COG2Q14746 738 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 CCDC121Q6ZUS5 278 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 THAP2Q9H0W7 228 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.38■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 P4HA2O15460 535 aa20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 NUDT17P0C025 328 aa20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 NF2P35240 595 aa20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 CENPTQ96BT3 561 aa20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 CSADQ9Y600 493 aa20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.37■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 C5orf60A6NFR6 353 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 GGPS1O95749 300 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TRIM49P0CI25 452 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TRIM49CP0CI26 452 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 HMGCS2P54868 508 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ALCAMQ13740 583 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 NEK9Q8TD19 979 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 MORC4Q8TE76 937 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TLCD1Q96CP7 247 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 PARP2Q9UGN5 583 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ZNF536O15090 1300 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 CHRNA3P32297 505 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 CEP55Q53EZ4 464 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 P3H4Q92791 437 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 STRA6Q9BX79 667 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.36■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 PODXLO00592 558 aa20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TMOD1P28289 359 aa20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 MAPK7Q13164 816 aa20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CYTH1-209ENST00000589296 TMEM206Q9H813 350 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms