RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPK6Q16659 721 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 NYAP1Q6ZVC0 841 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 REXO1L1PQ8IX06 675 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL13Q8N6R0 699 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PARD3BQ8TEW8 1205 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 SAAL1Q96ER3 474 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CHP1Q99653 195 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 KPNA6O60684 536 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKCBP05771 671 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 DLG4P78352 724 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKCZQ05513 592 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MTF1Q14872 753 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM187BQ17R55 369 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CBWD6Q4V339 395 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 RRAGAQ7L523 313 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 USP37Q86T82 979 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF186Q9NXI6 227 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 GCNT4Q9P109 453 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 NRCAMQ92823 1304 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF233A6NK53 670 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ACKR2O00590 384 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 UCHL3P15374 230 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 GJA9P57773 515 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CLDN10P78369 228 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP3CAQ08209 521 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MFSD10Q14728 455 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM65Q6PJ69 517 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 EVPLQ92817 2033 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC53A6NM62 1247 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TOM1L1O75674 476 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TUBB4AP04350 444 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ACTN1P12814 892 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PHKA2P46019 1235 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PSEN2P49810 448 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CAP1Q01518 475 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CETN1Q12798 172 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMD6Q15008 389 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 EPC2Q52LR7 807 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 LMO3Q8TAP4 145 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ABLIM1O14639 778 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 GJB1P08034 283 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC175P0C221 793 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PROZP22891 400 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXD10P28358 340 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 C1QTNF8P60827 252 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC42EP1Q00587 391 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP4Q96MN2 994 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRC4Q9NPP4 1024 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 COQ4Q9Y3A0 265 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SEPT4O43236 478 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFA10O95299 355 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 RFX1P22670 979 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 JAM2P57087 298 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAM17P78536 824 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 APBA1Q02410 837 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MCL1Q07820 350 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF410Q86VK4 478 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP7D2Q96T17 732 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.74■■□□□ 1.55
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