RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 GRIK3Q13003 919 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PDCLQ13371 301 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 VPS36Q86VN1 386 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD33BA6NCL7 494 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 P4HBP07237 508 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 TUBBP07437 444 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 QARSP47897 775 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SEZ6Q53EL9 994 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 FAM160B2Q86V87 743 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 IFT20Q8IY31 132 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 MICALL2Q8IY33 904 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 BSNDQ8WZ55 320 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 KRT13P13646 458 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 VAMP7P51809 220 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 EPHB4P54760 987 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PGM5Q15124 567 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SCARA3Q6AZY7 606 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 FAM76AQ8TAV0 307 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 KRT35Q92764 455 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SEMA4DQ92854 862 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 TEPSINQ96N21 525 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 STK24Q9Y6E0 443 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 A0A1B0GUA9 196 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ZNF233A6NK53 670 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 FTLP02792 175 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ZNF131P52739 623 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 MESDQ14696 234 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 DCAF12L1Q5VU92 463 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ARMCX6Q7L4S7 300 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ALG3Q92685 438 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 STK33Q9BYT3 514 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PGAP2Q9UHJ9 254 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 HACL1Q9UJ83 578 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 HSF2BPO75031 334 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 RTN2O75298 545 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 HSD17B4P51659 736 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 CFAP58Q5T655 872 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 B3GNT9Q6UX72 402 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 DMAC2Q9NW81 257 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 GABBR1Q9UBS5 961 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 FERP16591 822 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ADSSP30520 456 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ANO5Q75V66 913 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SPDL1Q96EA4 605 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PRKCIP41743 596 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 GUCY1A3Q02108 690 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 LMO3Q8TAP4 145 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 RNF146Q9NTX7 359 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PPME1Q9Y570 386 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 DENND3A2RUS2 1198 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SMIM23A6NLE4 172 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 GNGT1P63211 74 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 NNTQ13423 1086 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 CHADLQ6NUI6 762 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 WRNIP1Q96S55 665 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PDCD2LQ9BRP1 358 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ZNF862O60290 1169 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 MMEP08473 750 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 IRAK1P51617 712 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 TNIP1Q15025 636 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 CEP170P1Q96L14 293 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SCLT1Q96NL6 688 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms