RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582717.5

GGA3-214, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-214ENST00000582717 F8VZ95 297 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 HIP1RO75146 1068 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 GFPT2O94808 682 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 UCHL3P15374 230 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 COG2Q14746 738 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 QPCTQ16769 361 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 TLCD1Q96CP7 247 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 RAB17Q9H0T7 212 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 DNM1LO00429 736 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 DAPK3O43293 454 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 ATP9AO75110 1047 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 PPFIA2O75334 1257 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 H2AFZP0C0S5 128 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 TMOD1P28289 359 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 SLC8A1P32418 973 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 SCTRP47872 440 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 PADI6Q6TGC4 694 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 H2AFVQ71UI9 128 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 KLRG1Q96E93 195 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 C12orf42Q96LP6 360 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-214ENST00000582717 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 FDX1P10109 184 aa14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 ACTN1P12814 892 aa14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 DRD4P21917 467 aa14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 ELF1P32519 619 aa14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 UGCGQ16739 394 aa14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 ODR4Q5SWX8 454 aa14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 CCT6BQ92526 530 aa14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.71□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 WDR90Q96KV7 1748 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 UBE4BO95155 1302 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 SLC9A1P19634 815 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 CLUL1Q15846 466 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 SLC35C1Q96A29 364 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 BORCS6Q96GS4 357 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 HES6Q96HZ4 224 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 AMACRQ9UHK6 382 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 PNMA2Q9UL42 364 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 TMEM150BA6NC51 233 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 DSG3P32926 999 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 FLT3P36888 993 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 NFIL3Q16649 462 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 HVCN1Q96D96 273 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 FMO2Q99518 471 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 TTI1O43156 1089 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 CCNE2O96020 404 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 GSTA1P08263 222 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 RARRES1P49788 294 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 CROCCP2Q86T23 111 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 STRA6Q9BX79 667 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 AMFRQ9UKV5 643 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-214ENST00000582717 CEP83Q9Y592 693 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms