RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPN3-210ENST00000561817 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPN3-210ENST00000561817 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPN3-210ENST00000561817 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPN3-210ENST00000561817 ASB14A6NK59 587 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPN3-210ENST00000561817 TISP43B9A030 160 aa7.15□□□□□ -1.26
CAPN3-210ENST00000561817 K7ENM7 598 aa7.15□□□□□ -1.26
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CAPN3-210ENST00000561817 SLC16A4O15374 487 aa7.15□□□□□ -1.26
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CAPN3-210ENST00000561817 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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CAPN3-210ENST00000561817 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.15□□□□□ -1.26
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CAPN3-210ENST00000561817 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CAPN3-210ENST00000561817 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.15□□□□□ -1.26
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CAPN3-210ENST00000561817 MAPK13O15264 365 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPN3-210ENST00000561817 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CAPN3-210ENST00000561817 TBC1D8O95759 1140 aa7.14□□□□□ -1.27
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CAPN3-210ENST00000561817 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CAPN3-210ENST00000561817 MAP2K2P36507 400 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPN3-210ENST00000561817 STAT5BP51692 787 aa7.14□□□□□ -1.27
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CAPN3-210ENST00000561817 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.14□□□□□ -1.27
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CAPN3-210ENST00000561817 C17orf99Q6UX52 265 aa7.14□□□□□ -1.27
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CAPN3-210ENST00000561817 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPN3-210ENST00000561817 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPN3-210ENST00000561817 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPN3-210ENST00000561817 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.14□□□□□ -1.27
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