RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 CHRNB2P17787 502 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 GUCY1A3Q02108 690 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 TEPSINQ96N21 525 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 USP8P40818 1118 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 GPC5P78333 572 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 IWS1Q96ST2 819 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 PFASO15067 1338 aa24.38■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 WDR64B1ANS9 1081 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MYZAPP0CAP1 466 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 LSP1P33241 339 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 JAK3P52333 1124 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 XKR9Q5GH70 373 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 AADACL2Q6P093 401 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 KRT35Q92764 455 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SEMA4DQ92854 862 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 RMDN3Q96TC7 470 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 PXMP2Q9NR77 195 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MYO1FO00160 1098 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 RTN2O75298 545 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 DR1Q01658 176 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MTMR3Q13615 1198 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SAAL1Q96ER3 474 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ACP6Q9NPH0 428 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 TBX20Q9UMR3 447 aa24.37■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.36■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 EBAG9O00559 213 aa24.36■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ZEB2O60315 1214 aa24.36■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MARCKSL1P49006 195 aa24.36■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.36■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.36■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SPON1Q9HCB6 807 aa24.36■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.36■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 NPTX2P47972 431 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 PPP2R5EQ16537 467 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ANO5Q75V66 913 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 GLG1Q92896 1179 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 RAB17Q9H0T7 212 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 CENPHQ9H3R5 247 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC169A6NNP5 214 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 CYP26A1O43174 497 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SFNP31947 248 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 KRT76Q01546 638 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MTMR2Q13614 643 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 DUPD1Q68J44 220 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SHC3Q92529 594 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.35■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 EGFRP00533 1210 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MAGEA9P43362 315 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 CLUL1Q15846 466 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ERP44Q9BS26 406 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 TXLNGYQ9BZA5 131 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 NDUFAB1O14561 156 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MTA2O94776 668 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 GZMAP12544 262 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 FMO1Q01740 532 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 NSMFQ6X4W1 530 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 PARD3BQ8TEW8 1205 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 BSNDQ8WZ55 320 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 WNK4Q96J92 1243 aa24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RCCD1-208ENST00000557266 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms