RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 CLEC1BQ9P126 229 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 DNM3Q9UQ16 869 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 E9PMD0 336 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 B4GALT3O60512 393 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 MLH1P40692 756 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 NAMPTP43490 491 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 CUL4AQ13619 759 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 VPS52Q8N1B4 723 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 KIFAP3Q92845 792 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 GAD1Q99259 594 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 CD320Q9NPF0 282 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 MUC3AQ02505 3323 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 A0A1B0GUA9 196 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 DDHD2O94830 711 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 EYA4O95677 639 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 PRKCBP05771 671 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 MAPK6Q16659 721 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 FZD8Q9H461 694 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 ARL5CA6NH57 179 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 N4BP3O15049 544 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 CXCL14O95715 111 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 ALDH2P05091 517 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 SCNN1GP51170 649 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 COASYQ13057 564 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 FAM187BQ17R55 369 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 ZFP42Q96MM3 310 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 ZBP1Q9H171 429 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 PARP2Q9UGN5 583 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD1-208ENST00000555806 AKAP5P24588 427 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 ZP2Q05996 745 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 BRAPQ7Z569 592 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 ACKR2O00590 384 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 NRP1O14786 923 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 INPPL1O15357 1258 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 CTSAP10619 480 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 PDCP20941 246 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 OR1G1P47890 313 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 KCNK18Q7Z418 384 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 PLIN2Q99541 437 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 MIOSQ9NXC5 875 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 KLK14Q9P0G3 267 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 USP20Q9Y2K6 914 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC169A6NNP5 214 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 HIP1RO75146 1068 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 NR1I2O75469 434 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 EFNA5P52803 228 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 PEX3P56589 373 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.842e-6■■■■□ 20
NEDD1-208ENST00000555806 DRC1Q96MC2 740 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 PNMA5Q96PV4 448 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 BMP15O95972 392 aa20.29■□□□□ 0.84
NEDD1-208ENST00000555806 EDN1P05305 212 aa20.29■□□□□ 0.84
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