RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 HFM1A2PYH4 1435 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 TLDC2A0PJX2 215 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PATE3B3GLJ2 98 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ENPP3O14638 875 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 FOXS1O43638 330 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF20P17024 532 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ANTXR2P58335 489 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 DSG1Q02413 1049 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 NFYCQ13952 458 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PASD1Q8IV76 773 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 Q8TCH9 128 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 E9PCH4 1651 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 DAPK1P53355 1430 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 TNS2Q63HR2 1409 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 CDC14BO60729 498 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 GGNQ86UU5 652 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 KLC2Q9H0B6 622 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGEF10O15013 1369 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 KIF1AQ12756 1690 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ADCY9O60503 1353 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 MATN2O00339 956 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 APOL3O95236 402 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 GYS2P54840 703 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ADAM15Q13444 863 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 SLC15A2Q16348 729 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 DGKDQ16760 1214 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 EFHBQ8N7U6 833 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 VWA7Q9Y334 891 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 SBNO1A3KN83 1393 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 WDR90Q96KV7 1748 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 BCAR1P56945 870 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 ADCY2Q08462 1091 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 MYBPC3Q14896 1274 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 CFHR4Q92496 578 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 BORCS6Q96GS4 357 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 MYL10Q9BUA6 226 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 A0A087X0B3 334 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PLSCR1O15162 318 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 TGM5O43548 720 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 HGFACQ04756 655 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 LRRC32Q14392 662 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 HS1BP3Q53T59 392 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 FUKQ8N0W3 1084 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 C7orf31Q8N865 590 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-218ENST00000553309 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms