RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 HIC1Q14526 733 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 FAM47CQ5HY64 1035 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF410Q86VK4 478 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 CBWD2Q8IUF1 395 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 SLC35C1Q96A29 364 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 MSTO1Q9BUK6 570 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 FZD8Q9H461 694 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 KIAA1586Q9HCI6 787 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 SIK3Q9Y2K2 1263 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ACKR2O00590 384 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 EXTL3O43909 919 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 MFAP3LO75121 409 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 GYPCP04921 128 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ADRB2P07550 413 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 TRIM49P0CI25 452 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 TRIM49CP0CI26 452 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 HARSP12081 509 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ADAM17P78536 824 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 CDC42EP1Q00587 391 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM62Q0P6H9 643 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ATF7IP2Q5U623 682 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ZBTB33Q86T24 672 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 CNGA4Q8IV77 575 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 NEK11Q8NG66 645 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 IQCDQ96DY2 449 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 FAM213AQ9BRX8 229 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 TCHPQ9BT92 498 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 IFT122Q9HBG6 1241 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 WBP1LQ9NX94 342 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF233A6NK53 670 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 CLDN3O15551 220 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 TOM1L1O75674 476 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 MSNP26038 577 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 KCNMA1Q12791 1236 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 FAM187BQ17R55 369 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 KIZQ2M2Z5 673 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 TC2NQ8N9U0 490 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 SH3TC2Q8TF17 1288 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 VTI1AQ96AJ9 217 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 FBXL18Q96ME1 805 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 CRACR2AQ9BSW2 395 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 GINS2Q9Y248 185 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRR-209ENST00000549308 A0A0B4J269 797 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 TTLL13PA6NNM8 815 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 B4GALT5O43286 388 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 STX10O60499 249 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 ERLIN2O94905 339 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 HOXC8P31273 242 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 FMO5P49326 533 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 MYL7Q01449 175 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 CYP24A1Q07973 514 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 MPZL3Q6UWV2 235 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 GBP6Q6ZN66 633 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 USP37Q86T82 979 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC127Q96BQ5 260 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC51Q96ER9 411 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 HAPLN2Q9GZV7 340 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 CAPN11Q9UMQ6 739 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 TTC26A0AVF1 554 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 GPR32O75388 356 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 CABYRO75952 493 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 SKILP12757 684 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 KRT9P35527 623 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 ACOT2P49753 483 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 DLG4P78352 724 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 CCZ1BP86790 482 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 EXOC3L4Q17RC7 722 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF568Q3ZCX4 644 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 FIGNQ5HY92 759 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRR-209ENST00000549308 NME8Q8N427 588 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms