RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538361.1

C2CD3-211, Transcript of C2 calcium dependent domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene C2CD3, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3-211ENST00000538361 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.7□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ARL5CA6NH57 179 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 B4GALT5O43286 388 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 MBTPS2O43462 519 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 NR1I2O75469 434 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 POMCP01189 267 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 EFNA5P52803 228 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 COASYQ13057 564 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CUL4AQ13619 759 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 GIT2Q14161 759 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 IL17AQ16552 155 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 BRAPQ7Z569 592 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 GJD3Q8N144 294 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 VPS52Q8N1B4 723 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 FZD8Q9H461 694 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CLEC1BQ9P126 229 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.69□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 PP2D1A8MPX8 630 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 HIDE1A8MVS5 230 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 N4BP3O15049 544 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 DDHD2O94830 711 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 NPTXRO95502 500 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CXCL14O95715 111 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 BMP15O95972 392 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CDC25AP30304 524 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CA8P35219 290 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 SLC11A1P49279 550 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 AK8Q96MA6 479 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 GAD1Q99259 594 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 C5orf42Q9H799 3197 aa14.68□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 E9PMD0 336 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ACKR2O00590 384 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 INPPL1O15357 1258 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 GLP2RO95838 553 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 PRKCBP05771 671 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 MLH1P40692 756 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 BSNDQ8WZ55 320 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 DRC1Q96MC2 740 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 TIPINQ9BVW5 301 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 APOL6Q9BWW8 343 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 PARP2Q9UGN5 583 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 HES2Q9Y543 173 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.67□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CCDC169A6NNP5 214 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 K7ERI5 159 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 NRP1O14786 923 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 SLC26A4O43511 780 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CTSAP10619 480 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 LIG1P18858 919 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 AKAP5P24588 427 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ZP2Q05996 745 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 HYIQ5T013 277 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CASP10Q92851 521 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ZFP42Q96MM3 310 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ZBP1Q9H171 429 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 IRAK3Q9Y616 596 aa14.66□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 HIP1RO75146 1068 aa14.65□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 UBA7P41226 1012 aa14.65□□□□□ -0.06
C2CD3-211ENST00000538361 OR1G1P47890 313 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms