RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SPTLC1	O15269	473 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	OR1G1	P47890	313 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	GLUD2	P49448	558 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	RAB27A	P51159	221 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	DSC1	Q08554	894 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	RTN1	Q16799	776 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SLC5A5	Q92911	643 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	HES2	Q9Y543	173 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZMYND10	O75800	440 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	TDGF1	P13385	188 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	FSHR	P23945	695 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	LPAL2	Q16609	132 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ANO5	Q75V66	913 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	GAD1	Q99259	594 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	USP18	Q9UMW8	372 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PSMD10	O75832	226 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	NPEPPS	P55786	919 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	LMNB2	Q03252	620 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	FGF13	Q92913	245 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	SHD	Q96IW2	340 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	RIT2	Q99578	217 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	F5	P12259	2224 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM12	O43184	909 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB43	O43298	467 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	SDHB	P21912	280 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	MLH1	P40692	756 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	SCNN1G	P51170	649 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	MTAP	Q13126	283 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PPM1J	Q5JR12	505 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-222	ENST00000533557	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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