RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RDH13Q8NBN7 331 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNN1Q92952 543 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPB2Q96IY4 423 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MSTO1Q9BUK6 570 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPAN1O60635 241 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAND2O75155 1236 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TOM1L1O75674 476 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD4P01730 458 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIGRP01833 764 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CKBP12277 381 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF18P17022 549 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADSSP30520 456 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CASP4P49662 377 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FANCCQ00597 558 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MGAT3Q09327 533 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NFIL3Q16649 462 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AMHR2Q16671 573 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM26DQ5JW98 314 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IRF2BP1Q8IU81 584 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAGE1Q8TC20 777 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAAL1Q96ER3 474 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM5Q9C035 493 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VPS16Q9H269 839 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DMAC2Q9NW81 257 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFSF13BQ9Y275 285 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0B4J269 797 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF233A6NK53 670 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 N4BP3O15049 544 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR182O15218 404 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CBFA2T2O43439 604 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EXTL3O43909 919 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKAP3O75969 853 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GHRP10912 638 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRT13P13646 458 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SELPP16109 830 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AXLP30530 894 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD52P31358 61 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACOT2P49753 483 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBASH3AP57075 661 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAAP100Q0VG06 881 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRT31Q15323 416 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOTUMQ6P988 496 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM228AQ86W67 206 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPD1LQ8N335 351 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TOX2Q96NM4 488 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFNKQ9P0W0 207 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms