RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC11A1	P49279	550 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ZP2	Q05996	745 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	AMHR2	Q16671	573 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	CASP10	Q92851	521 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1B0GUA9	196 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	N4BP3	O15049	544 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	B4GALT5	O43286	388 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	PRKCB	P05771	671 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ALAD	P13716	330 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	LIG1	P18858	919 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	EFNA5	P52803	228 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	GAD1	Q99259	594 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	HES2	Q9Y543	173 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393		E9PMD0	336 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	INPPL1	O15357	1258 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	DDHD2	O94830	711 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	BMP15	O95972	392 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	CTSA	P10619	480 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	PDC	P20941	246 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	OR1G1	P47890	313 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ECM1	Q16610	540 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	FZD8	Q9H461	694 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBBP4-215	ENST00000524393	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	VCAN	P13611	3396 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	ACKR2	O00590	384 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	NRP1	O14786	923 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	AKAP5	P24588	427 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	CDC25A	P30304	524 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	SCNN1G	P51170	649 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	GRIK3	Q13003	919 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	MYO7A	Q13402	2215 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC169	A6NNP5	214 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393		K7ERI5	159 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBBP4-215	ENST00000524393	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19

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