RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM187BQ17R55 369 aa24.89■■□□□ 1.58
TSNARE1-208ENST00000524325 TCHPQ9BT92 498 aa24.89■■□□□ 1.58
TSNARE1-208ENST00000524325 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 PDXKO00764 312 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 IQCB1Q15051 598 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNN1Q92952 543 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 SAAL1Q96ER3 474 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.89■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.88■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.88■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.88■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.88■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.87■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 RDH13Q8NBN7 331 aa24.87■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 ABLIM1O14639 778 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 PIGRP01833 764 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 SYN1P17600 705 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 NR2F2P24468 414 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R2P41236 205 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 CASP4P49662 377 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 FANCLQ9NW38 375 aa24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 MGEA5O60502 916 aa24.86■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 TOM1L1O75674 476 aa24.86■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 OSTNP61366 133 aa24.86■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 MYL5Q02045 173 aa24.86■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.86■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 CEP120Q8N960 986 aa24.86■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 RAG1P15918 1043 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCD1P33897 745 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC63Q05C16 580 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP135Q66GS9 1140 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA0355O15063 1070 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 TIMP1P01033 207 aa24.85■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 VWCEQ96DN2 955 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.85■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 HES2Q9Y543 173 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 BECN2A8MW95 431 aa24.84■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 ACOT2P49753 483 aa24.84■■□□□ 1.57
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0B4J269 797 aa24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 CSF2RAP15509 400 aa24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 NOTUMQ6P988 496 aa24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 EVI5O60447 810 aa24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-208ENST00000524325 AKAP3O75969 853 aa24.83■■□□□ 1.57
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