RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	FZD9	O00144	591 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PMM2	O15305	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	RAD17	O75943	681 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP17A1	P05093	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CR2	P20023	1033 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	HTR3A	P46098	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	HERVK_113	P62684	666 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FAP	Q12884	760 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC32	Q14392	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	EPHA7	Q15375	998 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CLUL1	Q15846	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A087X1B8	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CUTA	O60888	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CFB	P00751	764 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PHKG2	P15735	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	HSPA6	P17066	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINB3	P29508	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	LSP1	P33241	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	INHBC	P55103	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	DGCR2	P98153	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	STK3	Q13188	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ACAP2	Q15057	778 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702		Q6ZSN1	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXP2	O15409	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CDC14B	O60729	498 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	NBN	O60934	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	VCAM1	P19320	739 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	AOAH	P28039	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	POLD1	P28340	1107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	MOGS	Q13724	837 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PDCD1	Q15116	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	GJA10	Q969M2	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-222	ENST00000522702	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MPIG6B	O95866	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	IL18BP	O95998	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MME	P08473	750 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MYB	P10242	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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