RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519445.5

KCNQ3-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene KCNQ3, Length 2,801 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3-202ENST00000519445 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 GMLQ99445 158 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SIX2Q9NPC8 291 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 PICK1Q9NRD5 415 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 GNA14O95837 355 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 ITIH3Q06033 890 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 CXCL9Q07325 125 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 ZNF844Q08AG5 666 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 TAF11Q15544 211 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 KLHL23Q8NBE8 558 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 STK32BQ9NY57 414 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 A6NHS1 94 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 PDHA1P08559 390 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 ABCB4P21439 1286 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 CAP2P40123 477 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 PRELPP51888 382 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 DLG4P78352 724 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SOX10P56693 466 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 PARVGQ9HBI0 331 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 PDXKO00764 312 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 HGSO14964 777 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 KCNA3P22001 575 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 MXRA7P84157 204 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 FIZ1Q96SL8 496 aa25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 HIP1RO75146 1068 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 RASA3Q14644 834 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 ACP6Q9NPH0 428 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 KCNK3O14649 394 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 PJA2O43164 708 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 CYP3A4P08684 503 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SPP2Q13103 211 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 PALB2Q86YC2 1186 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 DAW1Q8N136 415 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 MREGQ8N565 214 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 AP1M1Q9BXS5 423 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 ABCF3Q9NUQ8 709 aa25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 PIK3CDO00329 1044 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 NAB2Q15742 525 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SLC5A5Q92911 643 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 SLC12A4Q9UP95 1085 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 RAD51CO43502 376 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 MFN1Q8IWA4 741 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 CHMP6Q96FZ7 201 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3-202ENST00000519445 ZNF536O15090 1300 aa25.08■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.08■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.08■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 FERP16591 822 aa25.08■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 CCHCR1Q8TD31 782 aa25.08■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 OSGEPQ9NPF4 335 aa25.08■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 TEKT4Q8WW24 435 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 NAGPAQ9UK23 515 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 USP20Q9Y2K6 914 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 PEX10O60683 326 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 ZBTB7AO95365 584 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 FLT3P36888 993 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 RIPK1Q13546 671 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 UGCGQ16739 394 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 ANKS4BQ8N8V4 417 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 WHAMMQ8TF30 809 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3-202ENST00000519445 TAS2R14Q9NYV8 317 aa25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms