RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TISP43	B9A030	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	FANCG	O15287	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	P4HA2	O15460	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TLR2	O60603	784 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GH1	P01241	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SERPING1	P05155	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	UQCRH	P07919	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC10A3	P09131	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ACTN1	P12814	892 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KRT13	P13646	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	UCHL3	P15374	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GART	P22102	1010 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CNGA1	P29973	690 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	FMO5	P49326	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	VAMP7	P51809	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	INHBE	P58166	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	APBA1	Q02410	837 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	IRF5	Q13568	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	IER5	Q5VY09	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	RDH13	Q8NBN7	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	COPS5	Q92905	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PHOX2B	Q99453	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854		A6NJR5	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854		K7ERI5	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF263	O14978	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PJA2	O43164	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADCY3	O60266	1144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIF5C	O60282	957 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HBP1	O60381	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ABL1	P00519	1130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADRB2	P07550	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HOXC6	P09630	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANXA13	P27216	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CASQ1	P31415	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRKCI	P41743	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIF11	P52732	1056 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	VAV2	P52735	878 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	JAM2	P57087	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GNG11	P61952	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DLG4	P78352	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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