RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.22■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 PARVGQ9HBI0 331 aa22.22■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.22■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.22■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 VTNP04004 478 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 GAP43P17677 238 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 MCM4P33991 863 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 NAMPTP43490 491 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 AFMP43652 599 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 PHKA2P46019 1235 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 PAGE5Q96GU1 130 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.21■■□□□ 1.15
USP53-208ENST00000514305 MYMKA6NI61 221 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PLS3P13797 630 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 IDEP14735 1019 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 GPC3P51654 580 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 ASIC1P78348 528 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 GIT2Q14161 759 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 ARSHQ5FYA8 562 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 DYMQ7RTS9 669 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 RNF149Q8NC42 400 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 DEPTORQ8TB45 409 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 NLRP4Q96MN2 994 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 REEP2Q9BRK0 252 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PLVAPQ9BX97 442 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 TRIM9Q9C026 710 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 OCEL1Q9H607 264 aa22.2■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 NCK2O43639 380 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 NR1I2O75469 434 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 RPS6KA5O75582 802 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 SMC2O95347 1197 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 EFNA5P52803 228 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 MYCT1Q8N699 235 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 DACT1Q9NYF0 836 aa22.19■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 CCDC169A6NNP5 214 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 GPR182O15218 404 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 GRM6O15303 877 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 GPR32O75388 356 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 LINC00271P0C7V0 271 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 LIG1P18858 919 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 GLRA2P23416 452 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 DRP2Q13474 957 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 KIZQ2M2Z5 673 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 LRRC15Q8TF66 581 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PANK4Q9NVE7 773 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 FAM50BQ9Y247 325 aa22.18■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 DENND3A2RUS2 1198 aa22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 ZNF131P52739 623 aa22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PEX3P56589 373 aa22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 POSTNQ15063 836 aa22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 UNC13DQ70J99 1090 aa22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 STAMQ92783 540 aa22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 P2RX5Q93086 422 aa22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 RMND1Q9NWS8 449 aa22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 CLDND1Q9NY35 253 aa22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 ARID2Q68CP9 1835 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 A0A087WZ62 844 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 TRAK2O60296 914 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 ALCAMQ13740 583 aa22.16■■□□□ 1.14
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