RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 PFKMP08237 780 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 KRT15P19012 456 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 SDHBP21912 280 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TNFSF4P23510 183 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 COPB2P35606 906 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 STAT5AP42229 794 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF543Q08ER8 600 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 MUM1L1Q5H9M0 696 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CATSPEREQ5SY80 951 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 BTNL9Q6UXG8 535 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CEP68Q76N32 757 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 MIGA2Q7L4E1 593 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM52Q8NDY8 209 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 SEC14L1Q92503 715 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TTC14Q96N46 770 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 KCNJ15Q99712 375 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 LRFN3Q9BTN0 628 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TTLL2Q9BWV7 592 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CERS4Q9HA82 394 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 POLG2Q9UHN1 485 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 DENND2AQ9ULE3 1009 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CDY2AQ9Y6F7 541 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 NOTOA8MTQ0 251 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 K7ENM7 598 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 NCAM2O15394 837 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 FFAR2O15552 330 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TEKQ02763 1124 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 ROM1Q03395 351 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 LAPTM5Q13571 262 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 DAG1Q14118 895 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PITRM1Q5JRX3 1037 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TMC6Q7Z403 805 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 DTX1Q86Y01 620 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CREG2Q8IUH2 290 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 NETO2Q8NC67 525 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R35Q8TAP8 253 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CDADC1Q9BWV3 514 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PNPLA8Q9NP80 782 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 GPRC5BQ9NZH0 403 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 DUSP13Q9UII6 198 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 GPR52Q9Y2T5 361 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 LMTK3Q96Q04 1460 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PRSS38A1L453 326 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 C22orf46C9J442 243 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 HGSO14964 777 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 USP2O75604 605 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 IL18RAPO95256 599 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PIK3CBP42338 1070 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 MCAMP43121 646 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PRIM2P49643 509 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 HK3P52790 923 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 NRG3P56975 720 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 EGR3Q06889 387 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 MGAT2Q10469 447 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 BTBD8Q5XKL5 378 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 APOA5Q6Q788 366 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CMIPQ8IY22 773 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 SYTL1Q8IYJ3 562 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 C3orf20Q8ND61 904 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 SLC30A5Q8TAD4 765 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CALML6Q8TD86 181 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 RGMAQ96B86 450 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 EID2BQ96D98 161 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC120Q96HB5 630 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 G6PC3Q9BUM1 346 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 JAM3Q9BX67 310 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 STK33Q9BYT3 514 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 KCNK12Q9HB15 430 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 ERVK13-1Q9NX77 482 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 ASH2LQ9UBL3 628 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 SCOCQ9UIL1 159 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 TNIKQ9UKE5 1360 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 PTPRGP23470 1445 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-218ENST00000509368 IQGAP2Q13576 1575 aa2.65□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms