RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	SUSD6	Q92537	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	IPP	Q9Y573	584 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464		A0A1B0GUA9	196 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CXCL14	O95715	111 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CYP11B2	P19099	503 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	NAMPT	P43490	491 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC11A1	P49279	550 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	AMHR2	Q16671	573 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	N4BP3	O15049	544 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CA8	P35219	290 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	EFNA5	P52803	228 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PTGDR	Q13258	359 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	MAPK6	Q16659	721 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	FZD8	Q9H461	694 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	DDHD2	O94830	711 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	C1R	P00736	705 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	PDC	P20941	246 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	MTHFR	P42898	656 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	ACKR2	O00590	384 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	NRP1	O14786	923 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	POMC	P01189	267 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	SOD2	P04179	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	UROD	P06132	367 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	MLH1	P40692	756 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	DSC1	Q08554	894 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	GRIK3	Q13003	919 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCC3-208	ENST00000506464	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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